คุณค่าทางโภชนาการของไข่เยี่ยวม้ามาจากองค์ประกอบทางโภชนาการของไข่เยี่ยวม้าเป็นหลัก ไข่เยี่ยวม้าอุดมไปด้วยโปรตีนคุณภาพสูงซึ่งเป็นเอกลักษณ์ของไข่ ทุกๆ 100 กรัมจะมีโปรตีนประมาณ 14 กรัม เมื่อดองในสภาวะที่เป็นด่าง โปรตีนส่วนหนึ่งจะถูกย่อยสลายเป็นกรดอะมิโน (เช่น กรดกลูตามิก) ซึ่งทำให้มีรสชาติที่โดดเด่นขึ้นและมีอัตราการย่อยและดูดซึมที่สูงขึ้น ไข่เยี่ยวม้าสามารถให้สารอาหารพื้นฐานที่จำเป็นต่อการซ่อมแซมเนื้อเยื่อและการทำงานของระบบภูมิคุ้มกันแก่ร่างกายได้